《阿优之兔智来了2》的故事延续《阿优之神奇萝卜》系列，故事讲述的是阿U和他的小伙伴们看守的那颗巨大的超级萝卜有天突然变小了，博士怀疑是巨石阵的土壤含有某种只对大萝卜有作用的特殊物质，而现在这些物质已经受到了破坏，大萝卜得不到营养开始萎缩。博士推测萝卜岛周围的岛屿上一定还有同样的土壤，可以让大萝卜恢复原状。孩子们主动要求承担这个寻找土壤的任务，为了帮助大家，博士送来一只名叫兔智的机器人，它不仅智慧超群，还拥有各种能力，在保护萝卜的过程中发挥了重要作用。但是兔菲依旧不放弃自己的梦想，他带领手下跳跳和甩耳开着飞行器一路跟随阿U他们，发誓要得到超级萝卜。
大明初起，明太祖朱元璋设锦衣卫亲军指挥使司，后分设南北镇抚司，稽查百官，权势煊赫。锦衣卫沿袭百年，南北镇抚司势如水火，相争不下。朝堂党争激烈，江湖盗匪猖獗，盛世繁华之下，却隐藏着汹涌暗流……
为揭开秦烈里魂的秘密，本季中时光将回朔到秦烈刚刚加入器具宗外宗之时。彼时秦烈经李牧指点，为了寻找凌语诗，秦烈排除障碍通过了器具宗试炼，加入外宗。在唐思琪的指点下开始进行日常修炼。 由于在入宗考试中惹恼了唐思琪，秦烈在宗门内的生活处处被大师姐刁难。天长日久，二人之间竟然产生了一些不可名状的情愫。而这些也都被意图篡取宗门之位的梁少扬看在了眼里。期初梁少扬只是为了宗主之位接近唐思琪，但经过一段日子的接触，梁少扬也对大师姐产生了特殊的感觉……
