漠北当下表面平静，实则暗中涌动。王后述里朵正筹划一场大会，不良帅为探查漠北动向带着一众不良人出现在漠北，以降臣为首的四大尸祖在此期间也来到漠北开了家古董羹店，而神秘的杀人凶手更弄得人心惶惶，几方势力各怀心思....
白糖一行人经历了失去师傅的悲痛之后，他们将这种悲伤转化为力量，成功击败了邪恶的傀儡师。接着，他们踏上了前往小青（王晓彤 配音）故乡——身宗的旅程。身宗四面环海，风景如画，这里的星罗班一行人开始享受难得的宁静和美景。 然而，这段短暂的快乐很快被现实的无奈和艰辛取代。他们面对前所未有的困境，遇到更为强大的敌人，必须作出艰难的道德抉择和正义判断。在残酷的现实和邪恶敌人的磨砺下，星罗班和小青都开始进一步成长和改变。这段旅程不仅考验了他们的意志和能力，也逐渐揭示了小青身世的秘密，让他们的使命和目标变得更加清晰和紧迫。这个故事突显了主人公们在面对挑战和困难时的坚韧与成长，以及他们逐步揭示和理解自己身世秘密的过程。
在本季《超级飞侠12》中，超级飞侠依然会接收来自世界各地小朋友的电话，为小朋友定制他们需要的特别的东西，并将东西送到他们手上。当小朋友们遇到困难，乐迪会请求总部的帮助，超级飞侠将带来拥有各种属性的愿望能量球，和小朋友们一起摇身一变成为酷炫的愿望守护者，陪同小朋友一起解决问题。而上一季新登场的三位超级飞侠新成员：恐龙飞机超级飞侠大壮、速食卡车超级飞侠糯糯、高速火车超级飞侠咚咚，也会在这一季中展示他们的过人之处。而当困难升级，超级基地也会变成超级机器人，跟超级飞侠一起陪小朋友们度过难关。
自从王陆以灵剑派仙人为目标展开修行已经过了两年的岁月。他被赋予了“降临下界与俗世接触”的试炼，并前往自己出生的故乡。
出生于源国的青年 —— 碧涵，在某个重大事件后，承接了属于自己的使命，与师姐若讷一同踏上了寻找宝器「鸿蒙」的征程。这一路上与不同的人相遇，在完成使命的过程中，还有多少未知的事件在等待着他们？
