十方天域，强者为尊，少年林天被未婚妻萧韵联合莫家长子莫森骗光了家产，还被推下悬崖。侥幸未死的他终于幡然醒悟，决心向两家复仇，夺回属于自己的一切，在悬崖之下，他偶获神秘黑铁剑，此剑暗藏神功，竟助他炼成无上武道。因实力不足，他决定先拜入九阳武府，待实力成熟后再行复仇，不料武府长老却是莫森的大伯，林天内外交困，危机重重。林天开始低调行事，苦修武道，精修符阵之法，暗中出城历练，战赤面鬼，杀百足兽，夺血魂花，奇遇不断。他的实力飞速增长，萧莫两家却仍不知悔改，埋伏、暗杀，甚至发动全家势力进山围剿，而林天神功大成，自以一剑破之。且看少年林天如何喋血复仇，历经磨难，终成神王，一统十方之天界！
莫凡迁至魔都，卷入“秘密事件”的调查中。过程中，莫凡帮助唐月脱困，意外获得玫炎火种，再度觉醒双系，目标直指明珠学府。大学生活开始，召唤系迎来“斗兽大赛”的挑战。
战火纷飞的外星异世界，一艘太空船摆脱追兵高速离去。此刻在银河遥远的另一端，地球上的天才少年发明家阿纯正和一班朋友们过着无忧无虑的校园生活。晚上阿纯回到家时，家里自制的飞碟探测器突然警报大作。阿纯激动地邀约死党凌子前往郊外寻找坠落的飞碟，在一个燃烧着火焰的大坑旁边，阿纯找到了有生以来最大的发现——装有外星人的逃生舱……
在本季《超级飞侠12》中，超级飞侠依然会接收来自世界各地小朋友的电话，为小朋友定制他们需要的特别的东西，并将东西送到他们手上。当小朋友们遇到困难，乐迪会请求总部的帮助，超级飞侠将带来拥有各种属性的愿望能量球，和小朋友们一起摇身一变成为酷炫的愿望守护者，陪同小朋友一起解决问题。而上一季新登场的三位超级飞侠新成员：恐龙飞机超级飞侠大壮、速食卡车超级飞侠糯糯、高速火车超级飞侠咚咚，也会在这一季中展示他们的过人之处。而当困难升级，超级基地也会变成超级机器人，跟超级飞侠一起陪小朋友们度过难关。
瀛洲界内，诸子百家，唐诗宋词，皆有书灵。在《唐诗三百首》中醒来的书灵顾七绝，骑着《山海经》的神兽驳， 与为了养活自己和一群妹子而努力奋斗的乐五音一起踏上了一条寻找唤醒其他书灵的道路。
