“欢笑越多就跳得越高，泪水越多就变得越强。” 初中生活最后的夏天，双叶翔太郎邂逅了“男子艺术体操”，因此受到强烈吸引。 进入私立苍秀馆高级中学（通称：苍高）就读的翔太郎，敲响了男子艺术体操社的社办门。社办里，有许多有个性的学长们，以及初中男子艺术体操之星的美里良夜。 拼命热衷于一件事，热血青春的日子。有时受挫、有时错过，与伙伴们一同生活的每日，一起努力迈向同个目标，描绘一个团队奋力勇往直前的＂热血运动×青春偶像剧”。 这个春天，充满热情与冲劲的青春，即将开始。
在艾伦他们居住的帕拉迪岛之外，还存在一个其他人类居住的世界。当中一个国家「玛雷」与其他各国爆发战争。陷入苦战之际，他们决定要攻进帕拉迪岛，把「始祖的巨人」抢过来。在这里又看到另一群孩子们拼命求生存的身影……。
幼时曾深陷绝望深渊的直枝理树，与4位少年少女相遇了。 在那之后数年，理树作为Little Busters的一员，喧闹地过着快乐的每一天。 这样的时间能够一直持续就好了。理树所期望的只有这样。 某日，恭介突然表示要成立一支棒球队伍， 理树则开始了寻找成员的任务。 在这样的过程中，理树邂逅了新的成员们。 和大家一起参加试胆大会，潜入女生宿舍时被换上女装，一起演人偶剧……。 经历了许多快乐的事情， 同时也在大家的帮助下解决了各自拥有的烦恼。 最后在棒球比赛中，理树确认了和最好的朋友们之间的牵绊。 ——然而，这并不是结束。 和来谷唯湖之间的故事。 理树与铃的故事。 以及，理树和铃终于知晓的“世界的秘密”。 Little Busters真正的物语，自此开始——。
这个世界是存在异人的。刚刚接触异人世界的张楚岚，加入了管理异人的组织“哪都通”。为了解开爷爷和自身的秘密，张楚岚和冯宝宝一起前往龙虎山天师府参加异人界的盛会——罗天大醮，并与众多异人高手对战。
星元122年―― 在众多企业扩展到宇宙并构筑巨大经济圈的时代， 有一名少女自边境地区·水星转来MS产业的最大企业“贝纳里特集团”旗下所经营的“阿斯提卡西亚高等专门学园”。 她名为苏莱塔·墨丘利。 内心纯真的少女随着胸口鲜红的闪烁亮光逐步迈向新世界。
高中三年级的筒井光是所谓的御宅族少年。只要有游戏或动画里的二次元女生的话，感觉就能独自一人生活了……。但，他突然被超绝3D（现实）美少女·五十岚色叶告白，并开始和她交往！在被奔放的色叶玩弄于股掌之间的同时，筒井逐渐爱上了她……。
前田良树（花江夏树 配音）是一名普通的高中二年级男生，跟随着家人，良树回到了阔别已久的故乡，来到了当地名校蔷薇门高中，成为了那里的学生。这里的一切都是如此的熟悉，在这块留有儿时记忆的土地上，前田良树会遇到怎样的人，会经历怎样的事呢？ 个性活泼开朗爱恶作剧的足球部队长美剑咲夜（木村良平 配音）、个性大大咧咧生活在自己世界里的美术部顾问西园寺辉彦（铃木裕斗 配音）、良树曾经的青梅竹马早乙女拓也（柿原彻也 配音）、高傲冷酷不可一世的学生会会长镜莲儿（野宫一范 配音）、沉默寡言总是孤身一人的转学生志贺慎吾（鹤冈聪 配音），良树所要面对的，是这些个性迥异的男子们，他们能够成为好朋友吗？
