新的学年开始了，洛克和他的伙伴们努力学习，向最高难度的徽章发起挑战。然而，当洛克王国洛克和朋友们初次踏入幽暗空间时，却得知学院遭遇了空前的危机，播出由于时光扭曲，他们回到一个月之后的学院，此时学院已经完全沦陷，所有学生和老师都被恩佐控制。洛克和伙伴们想尽办法回到了原有的时空，找出的圣光羽石，粉碎了恩佐的阴谋，学院的危机被悄悄解除。
数学荒岛历险记3是《荒岛历险记》数学系列的第三部作品，是一部凝合了数学科普教育与少年励志为创作主题的动画连续剧。故事承接了第一部和第二部的剧情。讲述了博士只做了3分钟“世界之王”，就立马被打回原形了。原来愿望之码一旦被激活，便可掌控自己的意愿，它告诉大家，要想获得真正的愿望，必须要比赛答题。答对1道数学题，可以实现1个3分钟的愿望，答对8道数学题，可以实现1个永久愿望。 由此，博士和罗克双方才开始真正的较量。国王、花花、依依、小强等荒岛伙伴能适应地球的新生活吗？罗克和UBIQ又会如何迎接新挑战，解除荒岛危机呢？而博士也拉拢了一个新帮手，博士经典的愚蠢阴谋功力会不会大增呢？摆脱各方控制的愿望之码，又将会有怎样令人称奇的表现？新危机，新挑战，新故事，一场全新的数学较量马上就要展开了。
星幻岛上的欢乐和谐的生活引起了一波邪恶势力的不满和觊觎。在海洋深处有一个神秘的魔幻岛，岛主是没有欢笑没有快乐的呼噜大王，正是由于星幻岛的生活充满了太多快乐，而惹怒呼噜大王，决心打乱班纳他们的生活。于是派出自己的手下：双双、失失、冒冒三人去到星幻岛完成这一艰巨的任务。麻烦还不止这些，海博士的老冤家死对头，功夫岛岛主大虾博士也对星幻岛垂涎已久。看来星幻岛这下可是真的面临棘手的问题了，不过你可别忘了我们还有可爱的班纳在呢，天大的困难在他的戏耍中都会迎刃而解的。班纳这个小家伙可是不好惹的，最后大坏蛋们只能是偷鸡不成反蚀把米，给自己造成了种种困扰和麻烦，还反倒给班纳和他伙伴们的生活增添不少新的乐趣。
