在本季《超级飞侠12》中，超级飞侠依然会接收来自世界各地小朋友的电话，为小朋友定制他们需要的特别的东西，并将东西送到他们手上。当小朋友们遇到困难，乐迪会请求总部的帮助，超级飞侠将带来拥有各种属性的愿望能量球，和小朋友们一起摇身一变成为酷炫的愿望守护者，陪同小朋友一起解决问题。而上一季新登场的三位超级飞侠新成员：恐龙飞机超级飞侠大壮、速食卡车超级飞侠糯糯、高速火车超级飞侠咚咚，也会在这一季中展示他们的过人之处。而当困难升级，超级基地也会变成超级机器人，跟超级飞侠一起陪小朋友们度过难关。
阿狸发现这个世界上有许多人，虽然经历了成长，但是丢失了童心，变得困惑麻木和孤单。阿狸通过经历和冒险去帮助他们找回信心。期间帮助了贪吃的大仓鼠重新找到自己的定位和价值，帮助拾荒的地精收集了星星并送回天上。阿狸和桃子大熊误入了一个神秘的棋盘，通过智慧和勇气打败了骄傲的象棋白皇后。阿狸帮助了一个失去伴侣的坏脾气先生，找到失去的爱情和回忆。在小镇的剧场里，阿狸了解到了提线木偶的理想是当一个舞蹈家，阿狸鼓励他勇敢地追求自我，不要害怕失败。最终提线木偶受到了命运的眷顾。
高中生东方亮和小学生熊小毛是市电视台青少频道的实习记者和通讯员。一次偶然的事故，改变了他们两人的命运。这天，他们差点双双触电，幸好，电视台的美女主播安禾及时出现，眼疾手快地救了他俩。在得知安妮将要进行地球灾害现场采访的消息后，亮亮和小毛自告奋勇地要求加入。在触目惊心的龙卷风、地震、洪水、海啸和火灾等各种灾害面前，他们能安全归来吗？本片将带领观众真切体验平凡生命的崇高价值，找寻发现人类家园的美好明天。
拳打八岐大蛇，打不过就跪倒；脚踢麒麟石距，踢着了再求饶——那个没出息的阴阳师晴明带着跨级碰瓷的勇气和屡败屡战的斗志归来了！虽然衰神附体没得解、乌云盖顶难翻身，但他依然凭着爱与真诚聚拢了越来越多的式神家人和阴阳师伙伴，继续奋斗在状况百出的平安京大地上！
