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工藤新一是全国著名的高中生侦探，在一次追查黑衣人犯罪团伙时不幸被团伙成员发现，击晕后喂了神奇的药水，工藤新一变回了小孩！新一找到了经常帮助他的阿笠博士，博士为他度身打造不少间谍武器。为了防止犯罪团伙对他进行报复，新一决定隐姓埋名，暗中追查他们，希望能得到解药。一日，新一 的女友毛利兰来到了阿笠博士的家寻找男友的下落，被小兰撞见的新一情急之下编造了自己名叫江户川柯南，随后柯南寄居在了小兰家。小兰的父亲毛利小五郎是一名私家侦探，新一可以籍着和他一起四出办案一起追查黑夜人的下落。柯南在小学认识步美等小学生，他们一起组织了一个少年侦探团，向罪犯宣战！

　　名古屋にあるごく普通の学校・手羽先高校１年生の有は                                    
　　ＴＣＧトレーディングカードゲーム「Reバース」が大好きな女の子。                                    
                               　　ひょんなことから串カツ屋の看板娘千春・天才中学生周子とチームを結成！                                    
                               　　マッドサイエンティスト青・ミステリアスなただのいい人の梢・                                    
　　宇宙を見過ぎて足元を見ない育未もあつまってきて、                                    
                               　　にぎやかで充実のReバースライフを過ごしている。                                    
                               　　一方、東京・上野の名門校セントパンダ女学院では、                                    
                               　　有とスマホへの依存が止まらない圭・過剰に品行方正な京・                                    
　　食欲モンスター雪・庶民派の豊・覆面ミュージシャン樹里・                                    
　　何も考えていない沙希という面々が                                    
　　エレガントかつバイオレンスな寮生活を送っていた。                                    
                               　　Reバースをプレイする12人の少女達の「りばあす」な日々へ、                                    
                               　　Reバース GO!