动画的故事来源于网络爆红冷笑话“吃饭睡觉打豆豆”的创新延续，述说了呆萌可爱的黄豆，神秘地出现在南极，与一群性格独特的企鹅朋友间的爆笑趣事。呆萌可爱的豆豆拥有极强的好奇心，仿佛有用不完的精力，但由于天生呆萌，经常做出一些让人啼笑皆非的事情。
主角苏奕前世是独尊大荒的玄钧剑主，为追求无上剑道，选择转世重修，不曾想，在转世后，他最信任的大弟子勾结外敌，最宠溺的小徒弟为了得到九狱剑，也选择了背叛…… 转世后，苏奕的新身份是世俗国度大周玉京城苏氏的庶子，自幼备受冷落，怀疑母亲叶雨妃之死，和生父苏弘礼有关，为查明真相，毅然在十四岁那年离家出走，前往青河剑府修行。 不曾想，三年后，在苏奕即将成为青河剑府内门弟子时，忽然在一夜之间失去修为，沦为废人，就此成为青河剑府弃徒。 跌入低谷的苏奕，被迫接受苏家力量的安排，成了偏远小城三大宗族之一文家的上门女婿。 其妻
收服十万年前的诸天大佬们为徒，并拯救她们，修复崩坏的时间线，高冷道尊带女徒弟们开启冒险旅程。
特别篇动画《秦时明月之罗生堂下》是独立于动画《秦时明月》正传剧情之外的短篇番外故事。该动画讲述少司命年纪轻轻就从阴阳家弟子成为了阴阳家五大长老之一的经历。
