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那还是人与非人的世界未曾分开的远古故事。                                                                      　　流德雪尔率领的〈光之圣痕〉与魔神族的圣战，激化至波及布里塔尼亚全境。                                                                      　　取得3个戒禁的艾斯塔罗萨失控暴走，带走了伊丽莎白。金、高瑟、霍克、沙利叶、塔米叶紧随其后，抵达了天空演舞场遗址。                                                                      　　与此同时，在卡美洛城中，决定成为新魔神王的梅利奥达斯，在暗黑领域的茧中逐步获取戒禁。                                                                      　　为了拯救梅利奥达斯的灵魂而将自身投入炼狱的班，徘徊于常人决无法存活的瘴气当中。                                                                      　　逐渐明朗的艾斯塔罗萨的真正身份。崩坏的高瑟之禁咒。纠缠在一起的思绪将去往何方……                                                                      　　真正的敌人是谁？应讨伐之人为何物？                                                                      　　对抗“永远的生与永劫的轮回”这一命运，而持续了3000年旅程的梅利奥达斯与伊丽莎白。两人的旅途将会迎来怎样的结局——

电视动画《圣痕炼金士》改编自吉野弘幸原作、佐藤健悦作画的同名漫画。在漫画杂志《Champion RED》2009年7月号（2009年5月19日发售）上，发表了《圣痕炼金士》TV动画化的消息。电视动画于2010年1月9日首播，全24集。OVA动画第10.5集《女帝的肖像》随漫画单行本第10卷DVD限定版于2010年10月20日同捆推出。动画第2期《圣痕炼金士Ⅱ》于2011年4月11日播放。
某一天，就读圣米海洛夫学园的织部真冬见到了男主角亚历山大·尼古拉叶维奇赫尔(昵称沙夏)，他是一个俄国少年，能够通过吸吮圣乳而自由地操纵铁元素的炼金士，左脸有十字架型的圣痕，幼年时的恐怖经历造就了他的冷酷个性，别号致命者沙夏。
他的到来，使真冬以及灯的生活不再平静，卷入了炼金士们的战斗。埋藏长达两千年之久的圣像之迷，以这所学园为舞台展开了…………

2012年10月20日発売予定のコミック版第6巻限定版ブルーレイにテレビ未放送の第2期第11話を収録予定