在火星发现的神秘箱子――“潘多拉魔盒”打开的瞬间，巨大的墙壁突然出现！故事由此开始。被称为“天空之墙”的墙壁把日本列岛分割为三部分，并由此诞生了各自的首都「东都」「西都」「北都」。 其中在“东都”有被称为Smash的未确认生命体出现并暗中把人类逼入绝境。挡在Smash面前而出现的，是一位青年，其腰上戴着腰带、 手上握着不可思议的瓶子 。「变身！」―― 青年天才物理学者变身为假面骑士Build，阻挡在Smash的面前！
即将废社的时濑高中筝曲社。来到只身一人的社长面前的是不良少年和他的朋友们，以及古筝的天才少女。各自各自的古筝之乐所编奏的青春学园物语——
从前有位“光之巨人”，他负责保卫世界和平，对抗巨型怪物和外星人入侵的威胁。他就是机动奥特曼。他曾在执行任务时与科学考察队员早田进建立起联系，并在使命完成后离开了地球。时至今日，人类已进入了繁荣时代，但这只不过是和平的假象...现在，世界再次需要“光之巨人”的力量。就在这时，一个新的英雄出现了，他继承了光的基因。但是他并不高大，是一名中等身材、多愁善感的高中生，穿着金属动力制服。他的名字叫早田进次郎，是初代机动奥特曼早田进的儿子。早田进次郎克服种种困难成为新一代机动奥特曼，一个新的故事就此展开。
男高中生比企谷八幡（江口拓也 配音）性格别扭，孤僻乖张，既交不上朋友，也不敢跟女生说话。老师布置了“回顾高中生活”的作业，他却通篇愤世嫉俗之言，最后还发出了“给我爆炸吧”的诅咒。老师因此强行将他带去了只有一个部员的“侍奉部”，希望可以改变他的性格。这个社团的活动，就是拥有者将以慈悲之心施予贫乏者，简单地说，就是侍奉部里的志愿者向有困难的人伸出援手。侍奉部部长就是校内无人不晓的雪之下雪乃（早见沙织 配音），她头脑聪明，长相可爱，却为人高傲。雪之下要纠正比企谷的问题，而他却表示不必。因此老师提议他们决一胜负，赢的人就可以随意命令输的人。 比企谷与雪之下接触之后，发现女神级别的她也有自己的烦恼，两人似乎有相似之处。想提出交朋友要求的比企谷，被高贵冷艳的雪之下一口回绝。这对男女真的能在侍奉部里谱写出恋爱物语吗，还是注定只是一个错误的青春喜剧？
主人公因一次意外遇到太空女刑警巴迪，巴迪正在为了追捕潜伏于地球的极恶恐怖份子，但因为意外竟然误破坏了主人得身体细胞。后来为救回主角的性命，巴迪只好跟主角只好二心一体，共同生活。在主角跟巴迪在搜捕恐怖份子时，发挥了自我得特色，大大帮了巴迪得大忙，时间长了，主角也开始慢慢习惯了保卫地球得重任，努力于巴迪抵御外星敌人。
性格别扭且有些阴郁的青年叶月亮介（中村悠一 配音）喜欢上了附近花店“SHIMAO”的女主人六花（大原さやか 配音），但是他的爱慕之情却始终不敢说出口，只能一次次从六花那里买花，自怨自艾。这一天，机会终于来了，叶月去六花的店里应聘，距离虽然拉近，可是相谈仍是一件难事。更让他懊恼的是，某天他去拜访六花时，竟然发现屋里有一个只穿着内裤半裸的年轻男子，叶月顿觉自己的感情受到欺骗。未过多久，叶月意外得知，那名男子其实是六花3年前已经去世的丈夫岛尾笃（福山润 配音）。生前因多病而性格孤冷，去世后依旧记挂孤独而温柔的妻子，笃久久盘桓家中，不愿离开。亡灵岛津、未亡人六花以及青年叶月，一段奇妙的三角恋情在这个夏日悄悄上演…… 本片根据日本漫画家河内遥的同名原著改编。
