15世纪的欧洲某国。在跳级中被允许进入大学的神童拉法尔。他回应了周围的期待，宣布将专攻当时最重要的神学。但是，从以前开始就热心投入的对天文的热情一直没有被抛弃。 有一天，他遇到了一位名叫休伯特的神秘学者。因为触犯了基于异端思想的禁忌而受到拷问，被关进监狱的休伯特。 他研究的是关于宇宙的冲击性的“某个假说”——。
高中生少年八坂真寻的面前突然出现了一位银发碧眼的美少女，她自称是克苏鲁神话中登场的邪神·奈亚拉托提普，并且是宇宙人。从那以后，以奈亚子和真寻为中心的邪神（宇宙人）和地球人所引起的尽是麻烦的每一天开始了。
终结的炽天使短篇特典
不起眼的男高中生药院次郎，在“夫妻实习”的课堂上，和绝对不可能有关系的班上的美少女渡边星一起生活。他们对彼此的印象也很差。“阴”和“阳”不匹配非常刺激。洗完澡后的突发事件，突然的接触麻烦！？次郎虽然闷闷不乐，但还是下意识地想…… “喂，真的好好地玩夫妻游戏吧” 互相有想法的次郎和星为了得到交换组合的权利，认真地扮演夫妻。然而，酸甜苦辣的夫妻生活逐渐让彼此意识到各自的魅力。比“恋人”更刺激的，辣妹和无异性缘男生的“夫妻游戏”开始了。
时代再一次，使他成为必要之人。 为了对大坝建设时偶然发现的遗物“Artifact”进行研究而设立的联合国黑部研究所。 集合了世界各国智慧的研究所员的子女们所就读的立山国际高中，研究所长的女儿白羽由希奈也在那里就读。 时为2016年，夏。一位武士，再度睁开双眼。
