《果宝特攻3》讲述了 菠萝吹雪 偶然间穿越到了 古代 的水果世界。古代水果尚未经过培植改良，都是野果， 菠萝吹雪 从他们身上学习到中华兵法及古代书画，立志成为为民除害的 英雄 。 菠萝吹雪 开始修复时光机的 旅程 ，竟然遇到了水果伙伴们的 祖先 ，最后帮助他们打败了 火龙果 ，并顺利回到 现代 。
人妖共存又相争的世界，修炼术法、以斩妖除魔为己任的人们被称为妖师。国御妖师队长祁晓轩因一次意外结识了浪子虎子，二人共同踏上除魔卫道的旅途。现如今，世间已历经五百年的平静，妖魔们早已蠢蠢欲动，为他们的前路蒙上阴霾……
汽车帮帮队是谁？他们是帮助和服务大家的各种交通工具，有台风过后帮忙整理家园的工程车队、有每天清晨维护城市卫生的垃圾车与扫地车、有为大家安全护航的救护车与消防车，他们在各自的岗位上默默付出。他们让我们的生活变得更美好！
阿牛得到雷神托尔的神锤与火魔战斗，在朋友的帮助下战胜了火魔。接下来星猫一行人一起去狮王城寻找狮子座星座战士。阿杰进入狮王城打听到狮王城的国王白狮王和皇后神秘失踪，经过调查发现这一切都是狗头法师搞的鬼。马戏团里的小丑大牌竟然是失踪的狮王城王子？为什么白狮王和皇后被关在神秘的地牢？等等，关在地牢里的还有小吉和司令？ 乐观的两位小天使终于想起三弟从天神星发来的求救讯息，正当所有人为天神星发生的一切担心时，垃圾二人组之一的阿瑟叫醒了天神星十二判官，处刑人和执法官到底使用了什么秘密武器让天神星里被复制的魔化兵害怕？再次被吵醒的仙女姐姐看到蟑螂发生了什么？ 复制版的狗将军和太白老爹搭乘狗头战舰正赶往地球，星猫他们能化险为夷吗。
