《果宝特攻3》讲述了 菠萝吹雪 偶然间穿越到了 古代 的水果世界。古代水果尚未经过培植改良，都是野果， 菠萝吹雪 从他们身上学习到中华兵法及古代书画，立志成为为民除害的 英雄 。 菠萝吹雪 开始修复时光机的 旅程 ，竟然遇到了水果伙伴们的 祖先 ，最后帮助他们打败了 火龙果 ，并顺利回到 现代 。
一代武帝被害而陨落，万年之后重生在一位名为秦风的少年身上。觉醒无上神魂，修炼无上武道，从此风起云涌与无数天骄争锋，诸天万界都将因为他的回归而颤抖！
一个中国典型的三口之家，八零后的父母——小头爸爸和围裙妈妈，一个调皮可爱的的大头儿子。他们生活在现代化的城市中，过着平凡并充满乐趣的生活。 小头爸爸是一个心怀童真的大小孩，爱面子又贪玩，在大头儿子眼中，小头爸爸更像是朋友，而因为大头儿子的存在，小头爸爸也跟着一同成长。在陪伴大头儿子成长的这段时光里，他们一起玩...
传说每当黑渊现世，就会有一场天道大劫毁灭诸天万界，重启宇宙。少年林飞因筋脉缺陷无法修行，靠着小聪明在问剑宗混吃等死，直到大劫来临，恩师与挚友战死在黑渊才为虚度光阴而追悔莫及。他历经险阻另辟蹊径，习得上古炼器法为师门报仇，与魔头渊皇同归于尽。岂料因为神秘力量的干涉，他又在重启的新纪元中重生。为守护从大劫中被神秘人传承下来的问剑宗，为了相同的惨剧不再上演，林飞决心从一名边缘弟子做起，修万剑之道，集群英之力，破天道大劫，续文明火种。
在古老的天边，有一座美丽的欢乐之城，那里的人们在欢乐宝典的庇护下，一直过着宁静而快乐的生活。 但是，光明的背面总有阴影。一只被人遗弃的黑猫在风雨交加的夜晚，为了避寒，无意中躲进了塔楼。因为他无意偷看了欢乐宝典而变成了女人，兴奋的黑猫举起了欢乐宝典，谁知道宝典刚刚打开，可怕的事情就发生了：被宝典镇压着的恶龙腾空而起，天空中电闪雷鸣，原本美丽宁静的欢乐之城在一瞬间成为废墟并且裂成数块，所有的居民都变成了各种物品，而宝典也消失了。 这个巨变引发了时空扭曲，把三个野外探险的欢乐宝宝吸入石壁扔进了欢乐之城。仰望着悬浮在空中的废墟，欢想着回家，乐充满好奇和幻想，而豆只想着填饱肚子就万事大吉。三个孩子在废墟中漂浮着，直到他们遇到了已经变成麦克风的欢乐之城城主。孩子们的到来让本来已经绝望的城主看到了一丝希望，他拿出一个宝盒，告诉大家宝盒里藏着一个巨大的秘密，解开这个秘密，欢乐之城就能得救，而孩子们也能找到回家的路。 喜欢冒险的乐乐主动承担了这个责任，而欢欢和豆豆也不得不一共前去寻找宝典，宝宝们踏上了寻找欢乐宝典的道路。 他们从沿途遇到的小城居民身上学到了许多宝贵的经验。并与同样想得到宝典的黑猫斗智斗勇。刻板严谨的钟表师傅，使他们懂得了自制力的重要；因为心怀内疚而逃避现实、整天在云端游乐的邮差，让孩子们体会到了放弃责任后的痛苦和挣扎，从而决定要把身上的重担背负到底；外表怪癖内心温暖的科学怪人教会了欢欢各种有用的发明技巧，让欢欢由衷地佩服之余，也从中看到了自己的傲慢和固执；晴天婆婆和阴天婆婆的出现让对魔法着迷的乐乐欢呼雀跃，她帮助两个婆婆解开了缠绕在心头多年的心结，让她们重归于好。而两个婆婆也非常感激乐乐，她们送给乐乐一根魔杖和帽子，以及一本神奇的魔法书，实现了乐乐想成为魔法师的愿望。乐乐深深地体会到了帮助他人就是帮助自己的道理，因此更坚定了寻找宝典的决心。而贪吃懒惰的豆豆总是拖后腿，直到他遇到变成了烤炉的厨师，发掘了自己的烹饪天份，成为一个真正的美食家。 孩子们终于解开了一个个谜团， 欢乐宝宝在一个神秘人的帮助下终于找到了恶龙所在的小岛。找到了龙穴。欢乐宝宝们迎接新的战斗。
纣王断然拒绝“天”的神谕，将之投入火炬里烧毁，公然发布反抗神族之宣言。神族之主——“天”为此勃然大怒，带领神族的天间六部与周国军队来讨伐大商国。纣王与远古神兽不死鸟分享血与肉体，得到了原本属于神族才拥有的原始界神力。可惜还是不敌“天”之无色界神力，最后功败垂成。纣王之子武庚得到母亲妲己之帮助，逃过神族的追捕。后来沦落为采矿工厂的奴隶， 武庚从不赞同父亲的做法到体验到神族所带来的不平等待遇，立志颠覆神族。
一段全新的星际赛车之旅就此展开，猪猪侠将快速集合车队伙伴，克服各式各样来自赛道环境、机械故障的困难，还要面对五花八门的竞争对手，以及抢夺超星卜卜的星际盗贼团们，开始正义的太空飞车啦！
天宝十二年，天魔复生之期将至，妖王獬狱意图利用天魔统领妖族，颠覆人间，使人间成为妖族之地。人间驱魔司召集青年才俊重返长安，为四年之后的天魔现世做准备。在边境，驱魔司众人再度相聚，后续发现战死尸鬼的暴动。这一切的背后似乎都和传说中的白鹿有关，白鹿究竟在何处呢？
故事延续第二季主线，灵界与斗魂卫在利益纠葛之下冲突不断，本季灵界派出强盛军队欲对斗魂卫赶尽杀绝，两方势力都在以正在举办门宗大会的五法山为中心汇集，在这里发生着惨烈的战斗与冲突。
