故事发生在隋唐末年，隋文帝的次子杨广企图谋权篡位，为了避免遭到迫害，朝中重臣李渊（罗港生 配音）决定拖家带口离开京城这块是非地，返回故乡颐养天年。李渊的次子李世民（赵铭 配音）此时正陷入了同长孙无蓉（范雷颖 配音）的恋情之中，不愿意离开心爱之人的他想要留在京城，却遭到了无蓉的反对。 在返乡的途中，李世民遭到了杨广派出的杀手廖无极的袭击，手无寸铁的他命悬一线。在这个节骨眼上，偶然路过的秦琼拔刀相助，救了李世民一命，两人就此结下了不解之缘。之后，李世民还遇到了徐茂公、尉迟恭（袁国庆 配音）和程咬金（王肖兵 配音）等英雄好汉，在他们的辅佐之下，李世民能否推翻杨广的统治？
《神兽金刚2天神地兽》是一部具有浓郁中国特色的原创国产动画。它以中国文化为背景,大量运用中国传统神话与经典著作《山海经》中的奇山异兽,充分表现神话人物性格特征,展现了中国悠久灿烂的文化和五千年文明历史,众多新元素的加入为全片增添了奇异瑰丽的中国色彩。故事讲述了用爱和正义遏制邪恶,邪不胜正的故事,告诉孩子们,爱和正义是不可战胜的,秉着寓教育于乐趣中的理念。
皮皮鲁抢走了缩小芯片，带舒克贝塔回家。为躲避捕鼠队，三人从皮皮鲁家逃至交易市场。捕鼠队继续追击到这里。朋友加西和琪琪等布置了防御措施，与强大的机械狗、无人机对抗，老鼠科学家也来抢夺芯片。 危急关头，皮皮鲁选择缩小加西、方猎猎等，大家共同商议如何对付白客公司。同时，白客公司开始转移实验室。舒克贝塔琪琪等开着飞机坦克和摩托车与白客公司交战，夺回了实验室。但恢复芯片却落入白客手中。皮皮鲁改造升级了装备帮助大家潜入。 舒克贝塔终于找到恢复芯片，却不幸被捕鼠队长抓住，在监狱见到了旧敌白路。原来他因放电功能被抓来做实验。
